La continentalidad ambiental extrema del territorio es atenuada por las lluvias orográficas originadas por la disposición meridiana de los cordones montañosos del centro-oeste de la provincia sobre los vientos húmedos del noreste.

Las lluvias promedian los 300 mm. anuales alimentan los cursos temporarios de los ríos que descienden hacia los valles y bolsones, formando cuencas de drenaje endorreico cuyas aguas se insumen en el ámbito de los llanos riojanos.

En la región Cuyana de La Rioja predomina el clima árido andino puneño, con temperaturas muy bajas, por la altitud, lluvias insuficientes, por el relieve, nieves relativamente escasas, aire seco, humedad relativa baja y fuertes variaciones diarias de la temperatura, de hasta 45'º C.

El clima árido de sierras afecta a la mayor parte del territorio riojano, pero con diferentes comportamientos según se trate de sierras o llanos.

La temperatura en la zona serrana es menos intensa por la influencia de la altura y la sombra, mientras que en los llanos el verano es tórrido.

En cuanto a las precipitaciones, las sierras reciben abundantes y frecuentes lluvias, a diferencia de los llanos donde son insuficientes y se manifiestan en la época de mayor evaporación, noviembre a marzo.

A medida que los llanos predominan sobre las sierras, hacia el sur, se hace más extrema la aridez, rasgo destacado de esta región.